Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca5Q91ZW3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Smarca5Q91ZW3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms