Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Slc5a4bQ91ZP4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Slc5a4bQ91ZP4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Slc5a4bQ91ZP4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slc5a4bQ91ZP4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slc5a4bQ91ZP4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slc5a4bQ91ZP4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slc5a4bQ91ZP4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slc5a4bQ91ZP4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Slc5a4bQ91ZP4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Slc5a4bQ91ZP4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slc5a4bQ91ZP4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slc5a4bQ91ZP4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms