Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Synpo2Q91YE8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Synpo2Q91YE8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms