Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y16

Pcdha3, Protocadherin alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha3Q91Y16 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha3Q91Y16 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha3Q91Y16 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha3Q91Y16 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha3Q91Y16 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.7 ms