Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chrna2Q91X60 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chrna2Q91X60 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms