Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp3Q91W36 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp3Q91W36 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms