Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SelenomQ8VHC3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SelenomQ8VHC3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SelenomQ8VHC3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SelenomQ8VHC3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms