Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDD8

Washc1, WASH complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc1Q8VDD8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Washc1Q8VDD8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Washc1Q8VDD8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Washc1Q8VDD8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Washc1Q8VDD8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Washc1Q8VDD8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Washc1Q8VDD8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Washc1Q8VDD8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Washc1Q8VDD8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Washc1Q8VDD8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Washc1Q8VDD8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Washc1Q8VDD8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Washc1Q8VDD8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Washc1Q8VDD8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms