Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc6a20aQ8VDB9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc6a20aQ8VDB9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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