Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc8Q8VD72 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc8Q8VD72 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc8Q8VD72 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttc8Q8VD72 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttc8Q8VD72 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc8Q8VD72 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc8Q8VD72 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc8Q8VD72 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc8Q8VD72 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc8Q8VD72 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc8Q8VD72 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc8Q8VD72 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc8Q8VD72 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc8Q8VD72 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc8Q8VD72 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc8Q8VD72 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc8Q8VD72 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc8Q8VD72 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms