Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam20bQ8VCS3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20bQ8VCS3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam20bQ8VCS3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms