Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpap2Q8VC34 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpap2Q8VC34 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.5 ms