Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slf1Q8R3P9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slf1Q8R3P9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slf1Q8R3P9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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