Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2f4Q8R0K9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
E2f4Q8R0K9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2f4Q8R0K9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms