Protein–RNA interactions for Protein: Q8K025

Frat2, GSK-3-binding protein FRAT2, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat2Q8K025 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frat2Q8K025 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Frat2Q8K025 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frat2Q8K025 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frat2Q8K025 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frat2Q8K025 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frat2Q8K025 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frat2Q8K025 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frat2Q8K025 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frat2Q8K025 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Frat2Q8K025 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frat2Q8K025 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frat2Q8K025 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frat2Q8K025 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frat2Q8K025 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frat2Q8K025 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frat2Q8K025 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frat2Q8K025 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frat2Q8K025 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frat2Q8K025 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frat2Q8K025 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frat2Q8K025 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frat2Q8K025 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frat2Q8K025 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frat2Q8K025 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frat2Q8K025 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frat2Q8K025 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frat2Q8K025 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Frat2Q8K025 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frat2Q8K025 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Frat2Q8K025 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms