Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIM1

Lrrc45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc45Q8CIM1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrc45Q8CIM1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc45Q8CIM1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc45Q8CIM1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms