Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH18

Ccar1, Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccar1Q8CH18 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccar1Q8CH18 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccar1Q8CH18 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccar1Q8CH18 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccar1Q8CH18 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccar1Q8CH18 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms