Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG65

Sspo, SCO-spondin, mousemouse

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Length 4,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspoQ8CG65 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspoQ8CG65 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SspoQ8CG65 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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