Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms