Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam228aQ8CDW1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam228aQ8CDW1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam228aQ8CDW1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms