Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q8CD60 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q8CD60 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q8CD60 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q8CD60 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q8CD60 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8CD60 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8CD60 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8CD60 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8CD60 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8CD60 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8CD60 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q8CD60 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CD60 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CD60 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CD60 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CD60 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CD60 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q8CD60 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q8CD60 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q8CD60 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CD60 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CD60 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CD60 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CD60 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q8CD60 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CD60 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CD60 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CD60 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CD60 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q8CD60 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CD60 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CD60 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CD60 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CD60 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CD60 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CD60 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CD60 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CD60 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CD60 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CD60 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CD60 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CD60 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CD60 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CD60 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CD60 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CD60 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CD60 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CD60 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CD60 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CD60 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CD60 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CD60 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q8CD60 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CD60 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CD60 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CD60 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CD60 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CD60 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CD60 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CD60 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CD60 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CD60 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CD60 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CD60 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CD60 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CD60 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CD60 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CD60 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CD60 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CD60 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CD60 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CD60 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q8CD60 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CD60 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CD60 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CD60 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CD60 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CD60 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CD60 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CD60 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CD60 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CD60 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CD60 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CD60 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CD60 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CD60 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CD60 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CD60 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CD60 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CD60 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CD60 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CD60 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CD60 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CD60 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CD60 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CD60 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CD60 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CD60 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CD60 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms