Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsr2Q8C8T8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tsr2Q8C8T8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms