Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K3

Srsf12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf12Q8C8K3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf12Q8C8K3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf12Q8C8K3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf12Q8C8K3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf12Q8C8K3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf12Q8C8K3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf12Q8C8K3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf12Q8C8K3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf12Q8C8K3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf12Q8C8K3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf12Q8C8K3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf12Q8C8K3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf12Q8C8K3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf12Q8C8K3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Srsf12Q8C8K3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srsf12Q8C8K3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.5 ms