Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Alx1Q8C8B0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Alx1Q8C8B0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Alx1Q8C8B0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Alx1Q8C8B0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms