Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dclre1bQ8C7W7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dclre1bQ8C7W7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dclre1bQ8C7W7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dclre1bQ8C7W7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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