Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Bhlhe22Q8C6A8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms