Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Ubqln3Q8C5U9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Ubqln3Q8C5U9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubqln3Q8C5U9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubqln3Q8C5U9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubqln3Q8C5U9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubqln3Q8C5U9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubqln3Q8C5U9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubqln3Q8C5U9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubqln3Q8C5U9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubqln3Q8C5U9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubqln3Q8C5U9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubqln3Q8C5U9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubqln3Q8C5U9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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