Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cwc22Q8C5N3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cwc22Q8C5N3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cwc22Q8C5N3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cwc22Q8C5N3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms