Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc60Q8C4J0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc60Q8C4J0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc60Q8C4J0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms