Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nek11Q8C0Q4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nek11Q8C0Q4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nek11Q8C0Q4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek11Q8C0Q4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek11Q8C0Q4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek11Q8C0Q4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek11Q8C0Q4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek11Q8C0Q4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek11Q8C0Q4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek11Q8C0Q4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek11Q8C0Q4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek11Q8C0Q4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek11Q8C0Q4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nek11Q8C0Q4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nek11Q8C0Q4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nek11Q8C0Q4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nek11Q8C0Q4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Nek11Q8C0Q4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nek11Q8C0Q4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nek11Q8C0Q4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nek11Q8C0Q4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nek11Q8C0Q4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nek11Q8C0Q4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nek11Q8C0Q4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nek11Q8C0Q4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nek11Q8C0Q4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nek11Q8C0Q4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek11Q8C0Q4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek11Q8C0Q4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek11Q8C0Q4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nek11Q8C0Q4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
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