Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim35Q8C006 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim35Q8C006 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim35Q8C006 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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