Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc169Q8BXX9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc169Q8BXX9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc169Q8BXX9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms