Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc12Q8BW49 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ttc12Q8BW49 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc12Q8BW49 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc12Q8BW49 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc12Q8BW49 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc12Q8BW49 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc12Q8BW49 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc12Q8BW49 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc12Q8BW49 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc12Q8BW49 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc12Q8BW49 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc12Q8BW49 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc12Q8BW49 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc12Q8BW49 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc12Q8BW49 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc12Q8BW49 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc12Q8BW49 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc12Q8BW49 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.1 ms