Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pdcl3Q8BVF2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdcl3Q8BVF2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdcl3Q8BVF2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcl3Q8BVF2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms