Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp4aQ8BU40 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4aQ8BU40 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp4aQ8BU40 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.2 ms