Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep55Q8BT07 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep55Q8BT07 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep55Q8BT07 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cep55Q8BT07 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cep55Q8BT07 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cep55Q8BT07 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep55Q8BT07 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep55Q8BT07 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep55Q8BT07 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep55Q8BT07 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep55Q8BT07 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep55Q8BT07 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep55Q8BT07 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep55Q8BT07 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep55Q8BT07 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep55Q8BT07 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep55Q8BT07 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep55Q8BT07 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.7 ms