Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4dQ8BGV9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg4dQ8BGV9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg4dQ8BGV9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4dQ8BGV9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms