Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF0

AW551984, Expressed sequence AW551984, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW551984Q8BGF0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AW551984Q8BGF0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AW551984Q8BGF0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AW551984Q8BGF0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms