Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrtm2Q8BGA3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrtm2Q8BGA3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms