Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Necab1Q8BG18 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Necab1Q8BG18 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Necab1Q8BG18 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Necab1Q8BG18 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Necab1Q8BG18 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Necab1Q8BG18 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms