Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG07

Pld4, Phospholipase D4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld4Q8BG07 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pld4Q8BG07 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pld4Q8BG07 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pld4Q8BG07 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pld4Q8BG07 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pld4Q8BG07 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pld4Q8BG07 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pld4Q8BG07 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pld4Q8BG07 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pld4Q8BG07 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pld4Q8BG07 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pld4Q8BG07 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pld4Q8BG07 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pld4Q8BG07 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pld4Q8BG07 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pld4Q8BG07 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pld4Q8BG07 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pld4Q8BG07 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pld4Q8BG07 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pld4Q8BG07 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pld4Q8BG07 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms