Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim65Q8BFW4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim65Q8BFW4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms