Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Srgap3Q812A2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Srgap3Q812A2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Srgap3Q812A2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms