Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nrde2Q80XC6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nrde2Q80XC6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms