Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpp38Q80UU2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpp38Q80UU2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpp38Q80UU2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpp38Q80UU2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpp38Q80UU2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpp38Q80UU2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpp38Q80UU2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpp38Q80UU2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpp38Q80UU2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpp38Q80UU2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpp38Q80UU2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpp38Q80UU2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpp38Q80UU2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpp38Q80UU2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpp38Q80UU2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpp38Q80UU2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpp38Q80UU2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpp38Q80UU2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpp38Q80UU2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpp38Q80UU2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms