Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp8Q80U87 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp8Q80U87 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp8Q80U87 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp8Q80U87 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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