Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmc3Q7TQ69 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmc3Q7TQ69 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmc3Q7TQ69 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmc3Q7TQ69 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmc3Q7TQ69 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmc3Q7TQ69 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmc3Q7TQ69 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmc3Q7TQ69 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms