Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ07

Poln, DNA polymerase nu, mousemouse

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Length 864 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolnQ7TQ07 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PolnQ7TQ07 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PolnQ7TQ07 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PolnQ7TQ07 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms