Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sbno2Q7TNB8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sbno2Q7TNB8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sbno2Q7TNB8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms