Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SyncripQ7TMK9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SyncripQ7TMK9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SyncripQ7TMK9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SyncripQ7TMK9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SyncripQ7TMK9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SyncripQ7TMK9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SyncripQ7TMK9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SyncripQ7TMK9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SyncripQ7TMK9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SyncripQ7TMK9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SyncripQ7TMK9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SyncripQ7TMK9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms